В 1991 году общеобразовательная школа № 68 по заказу немецкого этноса, проживающего на территории Красноярского края, была реорганизована в школу с углубленным изучением немецкого языка.
В 2000 г. школа получила статус гимназии и педагогический коллектив разработал модель гимназии с лингвистической направленностью. Для формирования учебного учреждения такого типа создано своеобразное поликультурное пространство, определяющееся изучением родного языка, углубленным изучением двух иностранных языков, внеклассной работой по родному и иностранным языкам, особым укладом жизни гимназии с учетом культур стран изучаемых языков, дополнительным образованием по иностранным языкам. Помимо раннего обучения гимназистов немецкому языку со 2 класса и углубленному изучению данного языка с 5 класса, была предложена учащимся богатая и насыщенная программа внеклассной работы по немецкому языку.
С 1993 года гимназия начинает активно сотрудничать с Федеративной Республикой Германия в области изучения немецкого языка. 20 августа 2002 года было подписано соглашение с Конференцией министров по делам культуры и образования федеральных земель Федеративной Республики Германии об открытии на базе гимназии № 6 центра проведения экзамена на получение Немецкого языкового диплома второй ступени. Экзамен на получение Немецкого диплома международного уровня принимается представителями Управления зарубежных школ Федеративной Республики Германии, которые отмечают очень высокий уровень подготовки учащихся гимназии. С 2009 года гимназия № 6 г. Красноярска является базовой площадкой для проведения экзамена учащихся 9-х классов на получение Немецкого языкового диплома первой ступени.
В 2009 году Гимназия №6 стала участником инициативы «Школы: партнёры будущего» (ПАШ), которая объединяет около 2000 школ во всем мире, уделяющих особое внимание связям с Германией.ПАШ координирует Федеральное министерство иностранных дел, реализация осуществляется в сотрудничестве с Центральным управлением школ за рубежом, Гёте-Институтом, Германской службой академических обменов и Службой педагогических обменов Постоянной конференции министров культуры и образования.
